Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK4

Cabp2, Calcium-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp2Q9JLK4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cabp2Q9JLK4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cabp2Q9JLK4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cabp2Q9JLK4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cabp2Q9JLK4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cabp2Q9JLK4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cabp2Q9JLK4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cabp2Q9JLK4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cabp2Q9JLK4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cabp2Q9JLK4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cabp2Q9JLK4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cabp2Q9JLK4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cabp2Q9JLK4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cabp2Q9JLK4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cabp2Q9JLK4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cabp2Q9JLK4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cabp2Q9JLK4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cabp2Q9JLK4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cabp2Q9JLK4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Cabp2Q9JLK4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cabp2Q9JLK4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cabp2Q9JLK4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cabp2Q9JLK4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cabp2Q9JLK4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cabp2Q9JLK4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cabp2Q9JLK4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cabp2Q9JLK4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cabp2Q9JLK4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cabp2Q9JLK4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cabp2Q9JLK4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Cabp2Q9JLK4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cabp2Q9JLK4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cabp2Q9JLK4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cabp2Q9JLK4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cabp2Q9JLK4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Cabp2Q9JLK4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Cabp2Q9JLK4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cabp2Q9JLK4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cabp2Q9JLK4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cabp2Q9JLK4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cabp2Q9JLK4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cabp2Q9JLK4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cabp2Q9JLK4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cabp2Q9JLK4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cabp2Q9JLK4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cabp2Q9JLK4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cabp2Q9JLK4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cabp2Q9JLK4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cabp2Q9JLK4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cabp2Q9JLK4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Cabp2Q9JLK4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cabp2Q9JLK4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cabp2Q9JLK4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cabp2Q9JLK4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cabp2Q9JLK4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cabp2Q9JLK4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cabp2Q9JLK4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cabp2Q9JLK4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cabp2Q9JLK4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cabp2Q9JLK4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cabp2Q9JLK4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cabp2Q9JLK4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cabp2Q9JLK4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cabp2Q9JLK4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cabp2Q9JLK4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cabp2Q9JLK4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cabp2Q9JLK4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cabp2Q9JLK4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Cabp2Q9JLK4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cabp2Q9JLK4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cabp2Q9JLK4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms