Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scamp5Q9JKD3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scamp5Q9JKD3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scamp5Q9JKD3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scamp5Q9JKD3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scamp5Q9JKD3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scamp5Q9JKD3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scamp5Q9JKD3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scamp5Q9JKD3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scamp5Q9JKD3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scamp5Q9JKD3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scamp5Q9JKD3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scamp5Q9JKD3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scamp5Q9JKD3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scamp5Q9JKD3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scamp5Q9JKD3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scamp5Q9JKD3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scamp5Q9JKD3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scamp5Q9JKD3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scamp5Q9JKD3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scamp5Q9JKD3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scamp5Q9JKD3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scamp5Q9JKD3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scamp5Q9JKD3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scamp5Q9JKD3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scamp5Q9JKD3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scamp5Q9JKD3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scamp5Q9JKD3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scamp5Q9JKD3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scamp5Q9JKD3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms