Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nup50Q9JIH2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup50Q9JIH2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup50Q9JIH2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup50Q9JIH2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup50Q9JIH2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup50Q9JIH2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup50Q9JIH2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup50Q9JIH2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup50Q9JIH2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup50Q9JIH2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup50Q9JIH2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup50Q9JIH2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup50Q9JIH2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup50Q9JIH2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup50Q9JIH2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup50Q9JIH2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup50Q9JIH2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup50Q9JIH2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup50Q9JIH2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup50Q9JIH2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup50Q9JIH2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup50Q9JIH2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup50Q9JIH2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup50Q9JIH2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup50Q9JIH2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup50Q9JIH2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup50Q9JIH2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup50Q9JIH2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup50Q9JIH2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup50Q9JIH2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup50Q9JIH2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup50Q9JIH2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup50Q9JIH2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup50Q9JIH2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup50Q9JIH2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms