Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EefsecQ9JHW4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EefsecQ9JHW4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EefsecQ9JHW4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EefsecQ9JHW4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EefsecQ9JHW4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EefsecQ9JHW4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EefsecQ9JHW4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EefsecQ9JHW4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EefsecQ9JHW4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EefsecQ9JHW4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EefsecQ9JHW4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EefsecQ9JHW4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EefsecQ9JHW4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EefsecQ9JHW4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EefsecQ9JHW4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EefsecQ9JHW4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EefsecQ9JHW4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EefsecQ9JHW4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EefsecQ9JHW4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EefsecQ9JHW4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EefsecQ9JHW4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EefsecQ9JHW4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EefsecQ9JHW4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EefsecQ9JHW4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EefsecQ9JHW4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EefsecQ9JHW4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EefsecQ9JHW4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EefsecQ9JHW4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EefsecQ9JHW4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EefsecQ9JHW4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EefsecQ9JHW4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EefsecQ9JHW4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EefsecQ9JHW4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EefsecQ9JHW4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EefsecQ9JHW4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EefsecQ9JHW4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms