Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfrsf13bQ9ET35 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfrsf13bQ9ET35 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfrsf13bQ9ET35 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnfrsf13bQ9ET35 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnfrsf13bQ9ET35 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnfrsf13bQ9ET35 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfrsf13bQ9ET35 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf13bQ9ET35 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tnfrsf13bQ9ET35 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf13bQ9ET35 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf13bQ9ET35 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf13bQ9ET35 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf13bQ9ET35 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf13bQ9ET35 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf13bQ9ET35 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf13bQ9ET35 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf13bQ9ET35 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf13bQ9ET35 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf13bQ9ET35 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf13bQ9ET35 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf13bQ9ET35 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms