Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hapln2Q9ESM3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hapln2Q9ESM3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hapln2Q9ESM3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hapln2Q9ESM3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hapln2Q9ESM3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hapln2Q9ESM3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hapln2Q9ESM3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hapln2Q9ESM3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hapln2Q9ESM3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hapln2Q9ESM3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hapln2Q9ESM3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hapln2Q9ESM3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hapln2Q9ESM3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hapln2Q9ESM3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hapln2Q9ESM3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hapln2Q9ESM3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hapln2Q9ESM3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hapln2Q9ESM3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hapln2Q9ESM3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms