Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH4

Taf8, Transcription initiation factor TFIID subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf8Q9EQH4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Taf8Q9EQH4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf8Q9EQH4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf8Q9EQH4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf8Q9EQH4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Taf8Q9EQH4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Taf8Q9EQH4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf8Q9EQH4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Taf8Q9EQH4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf8Q9EQH4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf8Q9EQH4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Taf8Q9EQH4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf8Q9EQH4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Taf8Q9EQH4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Taf8Q9EQH4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Taf8Q9EQH4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Taf8Q9EQH4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf8Q9EQH4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf8Q9EQH4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf8Q9EQH4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Taf8Q9EQH4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms