Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP82

Wdr4, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit WDR4, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr4Q9EP82 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Wdr4Q9EP82 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Wdr4Q9EP82 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Wdr4Q9EP82 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms