Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnft1Q9DCN7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnft1Q9DCN7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnft1Q9DCN7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnft1Q9DCN7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnft1Q9DCN7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnft1Q9DCN7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnft1Q9DCN7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnft1Q9DCN7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnft1Q9DCN7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnft1Q9DCN7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnft1Q9DCN7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnft1Q9DCN7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnft1Q9DCN7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnft1Q9DCN7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnft1Q9DCN7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnft1Q9DCN7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnft1Q9DCN7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnft1Q9DCN7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnft1Q9DCN7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnft1Q9DCN7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnft1Q9DCN7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnft1Q9DCN7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnft1Q9DCN7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnft1Q9DCN7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnft1Q9DCN7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnft1Q9DCN7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnft1Q9DCN7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnft1Q9DCN7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnft1Q9DCN7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnft1Q9DCN7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnft1Q9DCN7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnft1Q9DCN7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnft1Q9DCN7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnft1Q9DCN7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnft1Q9DCN7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnft1Q9DCN7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnft1Q9DCN7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnft1Q9DCN7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnft1Q9DCN7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnft1Q9DCN7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnft1Q9DCN7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms