Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Riok3Q9DBU3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Riok3Q9DBU3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms