Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp2aQ9DB34 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp2aQ9DB34 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp2aQ9DB34 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms