Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc54Q9DAL3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc54Q9DAL3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc54Q9DAL3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms