Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA3

Uncharacterized protein C4orf36 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAA3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DAA3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DAA3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DAA3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9DAA3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9DAA3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9DAA3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9DAA3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms