Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg7Q9D906 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg7Q9D906 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg7Q9D906 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg7Q9D906 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg7Q9D906 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg7Q9D906 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg7Q9D906 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg7Q9D906 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg7Q9D906 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg7Q9D906 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg7Q9D906 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg7Q9D906 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg7Q9D906 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg7Q9D906 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg7Q9D906 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg7Q9D906 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg7Q9D906 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg7Q9D906 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg7Q9D906 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg7Q9D906 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg7Q9D906 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg7Q9D906 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atg7Q9D906 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atg7Q9D906 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atg7Q9D906 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atg7Q9D906 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atg7Q9D906 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atg7Q9D906 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg7Q9D906 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg7Q9D906 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg7Q9D906 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg7Q9D906 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg7Q9D906 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg7Q9D906 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg7Q9D906 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atg7Q9D906 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg7Q9D906 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg7Q9D906 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg7Q9D906 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg7Q9D906 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atg7Q9D906 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atg7Q9D906 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atg7Q9D906 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atg7Q9D906 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atg7Q9D906 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atg7Q9D906 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atg7Q9D906 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atg7Q9D906 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg7Q9D906 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg7Q9D906 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atg7Q9D906 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg7Q9D906 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg7Q9D906 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg7Q9D906 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg7Q9D906 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg7Q9D906 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg7Q9D906 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg7Q9D906 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg7Q9D906 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg7Q9D906 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg7Q9D906 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg7Q9D906 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg7Q9D906 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg7Q9D906 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg7Q9D906 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg7Q9D906 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg7Q9D906 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg7Q9D906 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg7Q9D906 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg7Q9D906 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms