Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
U2af1Q9D883 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
U2af1Q9D883 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
U2af1Q9D883 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
U2af1Q9D883 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
U2af1Q9D883 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
U2af1Q9D883 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
U2af1Q9D883 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
U2af1Q9D883 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
U2af1Q9D883 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
U2af1Q9D883 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
U2af1Q9D883 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
U2af1Q9D883 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
U2af1Q9D883 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
U2af1Q9D883 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
U2af1Q9D883 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
U2af1Q9D883 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
U2af1Q9D883 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
U2af1Q9D883 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
U2af1Q9D883 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
U2af1Q9D883 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
U2af1Q9D883 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
U2af1Q9D883 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
U2af1Q9D883 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
U2af1Q9D883 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
U2af1Q9D883 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
U2af1Q9D883 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
U2af1Q9D883 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
U2af1Q9D883 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
U2af1Q9D883 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
U2af1Q9D883 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
U2af1Q9D883 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
U2af1Q9D883 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
U2af1Q9D883 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
U2af1Q9D883 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
U2af1Q9D883 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
U2af1Q9D883 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
U2af1Q9D883 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
U2af1Q9D883 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
U2af1Q9D883 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
U2af1Q9D883 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
U2af1Q9D883 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
U2af1Q9D883 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
U2af1Q9D883 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
U2af1Q9D883 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
U2af1Q9D883 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
U2af1Q9D883 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
U2af1Q9D883 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
U2af1Q9D883 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
U2af1Q9D883 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
U2af1Q9D883 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
U2af1Q9D883 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
U2af1Q9D883 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
U2af1Q9D883 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
U2af1Q9D883 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
U2af1Q9D883 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
U2af1Q9D883 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
U2af1Q9D883 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
U2af1Q9D883 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
U2af1Q9D883 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
U2af1Q9D883 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
U2af1Q9D883 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
U2af1Q9D883 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
U2af1Q9D883 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
U2af1Q9D883 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
U2af1Q9D883 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
U2af1Q9D883 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
U2af1Q9D883 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
U2af1Q9D883 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
U2af1Q9D883 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
U2af1Q9D883 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
U2af1Q9D883 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
U2af1Q9D883 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
U2af1Q9D883 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
U2af1Q9D883 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
U2af1Q9D883 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
U2af1Q9D883 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
U2af1Q9D883 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
U2af1Q9D883 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
U2af1Q9D883 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
U2af1Q9D883 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
U2af1Q9D883 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
U2af1Q9D883 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
U2af1Q9D883 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
U2af1Q9D883 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
U2af1Q9D883 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
U2af1Q9D883 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
U2af1Q9D883 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
U2af1Q9D883 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
U2af1Q9D883 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
U2af1Q9D883 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
U2af1Q9D883 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
U2af1Q9D883 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
U2af1Q9D883 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
U2af1Q9D883 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
U2af1Q9D883 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
U2af1Q9D883 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
U2af1Q9D883 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
U2af1Q9D883 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
U2af1Q9D883 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms