Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capns2Q9D7J7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capns2Q9D7J7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capns2Q9D7J7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capns2Q9D7J7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capns2Q9D7J7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capns2Q9D7J7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capns2Q9D7J7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capns2Q9D7J7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capns2Q9D7J7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capns2Q9D7J7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capns2Q9D7J7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Capns2Q9D7J7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Capns2Q9D7J7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capns2Q9D7J7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capns2Q9D7J7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Capns2Q9D7J7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capns2Q9D7J7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capns2Q9D7J7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Capns2Q9D7J7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capns2Q9D7J7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capns2Q9D7J7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capns2Q9D7J7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capns2Q9D7J7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Capns2Q9D7J7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Capns2Q9D7J7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capns2Q9D7J7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capns2Q9D7J7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capns2Q9D7J7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capns2Q9D7J7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Capns2Q9D7J7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Capns2Q9D7J7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capns2Q9D7J7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capns2Q9D7J7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capns2Q9D7J7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capns2Q9D7J7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capns2Q9D7J7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capns2Q9D7J7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capns2Q9D7J7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capns2Q9D7J7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capns2Q9D7J7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capns2Q9D7J7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Capns2Q9D7J7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capns2Q9D7J7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capns2Q9D7J7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capns2Q9D7J7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capns2Q9D7J7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Capns2Q9D7J7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capns2Q9D7J7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capns2Q9D7J7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capns2Q9D7J7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capns2Q9D7J7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capns2Q9D7J7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Capns2Q9D7J7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capns2Q9D7J7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capns2Q9D7J7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.8 ms