Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chmp4cQ9D7F7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chmp4cQ9D7F7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chmp4cQ9D7F7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chmp4cQ9D7F7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chmp4cQ9D7F7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chmp4cQ9D7F7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chmp4cQ9D7F7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chmp4cQ9D7F7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chmp4cQ9D7F7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chmp4cQ9D7F7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chmp4cQ9D7F7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chmp4cQ9D7F7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Chmp4cQ9D7F7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chmp4cQ9D7F7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chmp4cQ9D7F7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chmp4cQ9D7F7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chmp4cQ9D7F7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chmp4cQ9D7F7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Chmp4cQ9D7F7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chmp4cQ9D7F7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chmp4cQ9D7F7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Chmp4cQ9D7F7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chmp4cQ9D7F7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chmp4cQ9D7F7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chmp4cQ9D7F7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chmp4cQ9D7F7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Chmp4cQ9D7F7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chmp4cQ9D7F7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Chmp4cQ9D7F7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chmp4cQ9D7F7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chmp4cQ9D7F7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Chmp4cQ9D7F7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chmp4cQ9D7F7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chmp4cQ9D7F7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chmp4cQ9D7F7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chmp4cQ9D7F7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chmp4cQ9D7F7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chmp4cQ9D7F7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chmp4cQ9D7F7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chmp4cQ9D7F7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chmp4cQ9D7F7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Chmp4cQ9D7F7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chmp4cQ9D7F7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chmp4cQ9D7F7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chmp4cQ9D7F7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chmp4cQ9D7F7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Chmp4cQ9D7F7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chmp4cQ9D7F7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chmp4cQ9D7F7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chmp4cQ9D7F7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chmp4cQ9D7F7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chmp4cQ9D7F7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chmp4cQ9D7F7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chmp4cQ9D7F7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chmp4cQ9D7F7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chmp4cQ9D7F7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Chmp4cQ9D7F7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chmp4cQ9D7F7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chmp4cQ9D7F7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chmp4cQ9D7F7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chmp4cQ9D7F7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chmp4cQ9D7F7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chmp4cQ9D7F7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms