Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cmtm5Q9D6G9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cmtm5Q9D6G9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cmtm5Q9D6G9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cmtm5Q9D6G9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cmtm5Q9D6G9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cmtm5Q9D6G9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cmtm5Q9D6G9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cmtm5Q9D6G9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cmtm5Q9D6G9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cmtm5Q9D6G9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cmtm5Q9D6G9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cmtm5Q9D6G9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cmtm5Q9D6G9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cmtm5Q9D6G9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cmtm5Q9D6G9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cmtm5Q9D6G9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cmtm5Q9D6G9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cmtm5Q9D6G9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cmtm5Q9D6G9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cmtm5Q9D6G9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cmtm5Q9D6G9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cmtm5Q9D6G9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cmtm5Q9D6G9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cmtm5Q9D6G9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cmtm5Q9D6G9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cmtm5Q9D6G9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cmtm5Q9D6G9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cmtm5Q9D6G9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cmtm5Q9D6G9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cmtm5Q9D6G9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cmtm5Q9D6G9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cmtm5Q9D6G9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cmtm5Q9D6G9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cmtm5Q9D6G9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cmtm5Q9D6G9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cmtm5Q9D6G9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cmtm5Q9D6G9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cmtm5Q9D6G9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cmtm5Q9D6G9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cmtm5Q9D6G9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cmtm5Q9D6G9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cmtm5Q9D6G9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cmtm5Q9D6G9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cmtm5Q9D6G9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cmtm5Q9D6G9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cmtm5Q9D6G9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cmtm5Q9D6G9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cmtm5Q9D6G9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cmtm5Q9D6G9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cmtm5Q9D6G9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cmtm5Q9D6G9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cmtm5Q9D6G9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cmtm5Q9D6G9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cmtm5Q9D6G9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cmtm5Q9D6G9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cmtm5Q9D6G9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cmtm5Q9D6G9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cmtm5Q9D6G9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cmtm5Q9D6G9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cmtm5Q9D6G9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cmtm5Q9D6G9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cmtm5Q9D6G9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cmtm5Q9D6G9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cmtm5Q9D6G9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cmtm5Q9D6G9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cmtm5Q9D6G9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cmtm5Q9D6G9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cmtm5Q9D6G9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cmtm5Q9D6G9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cmtm5Q9D6G9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cmtm5Q9D6G9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cmtm5Q9D6G9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cmtm5Q9D6G9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cmtm5Q9D6G9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cmtm5Q9D6G9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cmtm5Q9D6G9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cmtm5Q9D6G9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cmtm5Q9D6G9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cmtm5Q9D6G9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cmtm5Q9D6G9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cmtm5Q9D6G9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cmtm5Q9D6G9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cmtm5Q9D6G9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cmtm5Q9D6G9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cmtm5Q9D6G9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cmtm5Q9D6G9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cmtm5Q9D6G9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cmtm5Q9D6G9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cmtm5Q9D6G9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cmtm5Q9D6G9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cmtm5Q9D6G9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cmtm5Q9D6G9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cmtm5Q9D6G9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cmtm5Q9D6G9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cmtm5Q9D6G9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cmtm5Q9D6G9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cmtm5Q9D6G9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cmtm5Q9D6G9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cmtm5Q9D6G9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms