Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab11fip1Q9D620 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab11fip1Q9D620 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab11fip1Q9D620 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab11fip1Q9D620 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab11fip1Q9D620 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rab11fip1Q9D620 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab11fip1Q9D620 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab11fip1Q9D620 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab11fip1Q9D620 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab11fip1Q9D620 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rab11fip1Q9D620 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab11fip1Q9D620 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab11fip1Q9D620 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab11fip1Q9D620 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab11fip1Q9D620 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rab11fip1Q9D620 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rab11fip1Q9D620 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab11fip1Q9D620 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab11fip1Q9D620 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab11fip1Q9D620 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab11fip1Q9D620 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab11fip1Q9D620 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab11fip1Q9D620 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab11fip1Q9D620 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab11fip1Q9D620 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab11fip1Q9D620 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rab11fip1Q9D620 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab11fip1Q9D620 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab11fip1Q9D620 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rab11fip1Q9D620 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab11fip1Q9D620 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab11fip1Q9D620 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab11fip1Q9D620 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab11fip1Q9D620 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab11fip1Q9D620 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab11fip1Q9D620 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rab11fip1Q9D620 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rab11fip1Q9D620 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab11fip1Q9D620 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab11fip1Q9D620 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rab11fip1Q9D620 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rab11fip1Q9D620 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rab11fip1Q9D620 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rab11fip1Q9D620 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rab11fip1Q9D620 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rab11fip1Q9D620 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab11fip1Q9D620 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab11fip1Q9D620 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab11fip1Q9D620 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab11fip1Q9D620 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab11fip1Q9D620 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab11fip1Q9D620 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab11fip1Q9D620 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rab11fip1Q9D620 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab11fip1Q9D620 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab11fip1Q9D620 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab11fip1Q9D620 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rab11fip1Q9D620 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab11fip1Q9D620 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab11fip1Q9D620 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab11fip1Q9D620 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab11fip1Q9D620 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rab11fip1Q9D620 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rab11fip1Q9D620 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab11fip1Q9D620 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab11fip1Q9D620 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab11fip1Q9D620 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab11fip1Q9D620 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rab11fip1Q9D620 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rab11fip1Q9D620 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
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