Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stag1Q9D3E6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stag1Q9D3E6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stag1Q9D3E6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stag1Q9D3E6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stag1Q9D3E6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stag1Q9D3E6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stag1Q9D3E6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stag1Q9D3E6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stag1Q9D3E6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stag1Q9D3E6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stag1Q9D3E6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Stag1Q9D3E6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Stag1Q9D3E6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Stag1Q9D3E6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Stag1Q9D3E6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Stag1Q9D3E6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Stag1Q9D3E6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Stag1Q9D3E6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Stag1Q9D3E6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Stag1Q9D3E6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Stag1Q9D3E6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Stag1Q9D3E6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Stag1Q9D3E6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Stag1Q9D3E6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Stag1Q9D3E6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Stag1Q9D3E6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Stag1Q9D3E6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Stag1Q9D3E6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Stag1Q9D3E6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Stag1Q9D3E6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Stag1Q9D3E6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Stag1Q9D3E6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Stag1Q9D3E6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Stag1Q9D3E6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Stag1Q9D3E6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Stag1Q9D3E6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Stag1Q9D3E6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Stag1Q9D3E6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Stag1Q9D3E6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Stag1Q9D3E6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Stag1Q9D3E6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Stag1Q9D3E6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Stag1Q9D3E6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Stag1Q9D3E6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Stag1Q9D3E6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Stag1Q9D3E6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Stag1Q9D3E6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Stag1Q9D3E6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Stag1Q9D3E6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Stag1Q9D3E6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Stag1Q9D3E6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Stag1Q9D3E6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Stag1Q9D3E6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Stag1Q9D3E6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Stag1Q9D3E6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Stag1Q9D3E6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Stag1Q9D3E6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Stag1Q9D3E6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Stag1Q9D3E6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Stag1Q9D3E6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Stag1Q9D3E6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Stag1Q9D3E6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Stag1Q9D3E6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms