Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Necap2Q9D1J1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Necap2Q9D1J1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Necap2Q9D1J1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms