Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc167Q9D162 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc167Q9D162 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc167Q9D162 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc167Q9D162 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc167Q9D162 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc167Q9D162 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc167Q9D162 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc167Q9D162 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc167Q9D162 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc167Q9D162 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc167Q9D162 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc167Q9D162 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc167Q9D162 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc167Q9D162 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc167Q9D162 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc167Q9D162 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc167Q9D162 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc167Q9D162 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc167Q9D162 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc167Q9D162 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc167Q9D162 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc167Q9D162 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc167Q9D162 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc167Q9D162 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc167Q9D162 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc167Q9D162 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc167Q9D162 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc167Q9D162 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc167Q9D162 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc167Q9D162 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc167Q9D162 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc167Q9D162 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc167Q9D162 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc167Q9D162 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc167Q9D162 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc167Q9D162 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc167Q9D162 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc167Q9D162 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc167Q9D162 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc167Q9D162 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc167Q9D162 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc167Q9D162 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc167Q9D162 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc167Q9D162 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc167Q9D162 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc167Q9D162 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc167Q9D162 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc167Q9D162 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc167Q9D162 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc167Q9D162 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc167Q9D162 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc167Q9D162 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc167Q9D162 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc167Q9D162 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms