Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem88Q9D0N8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmem88Q9D0N8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem88Q9D0N8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem88Q9D0N8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms