Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfc5Q9D0F6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfc5Q9D0F6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rfc5Q9D0F6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfc5Q9D0F6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfc5Q9D0F6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfc5Q9D0F6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rfc5Q9D0F6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfc5Q9D0F6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfc5Q9D0F6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfc5Q9D0F6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfc5Q9D0F6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfc5Q9D0F6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rfc5Q9D0F6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfc5Q9D0F6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfc5Q9D0F6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfc5Q9D0F6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfc5Q9D0F6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfc5Q9D0F6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfc5Q9D0F6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfc5Q9D0F6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfc5Q9D0F6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfc5Q9D0F6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfc5Q9D0F6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfc5Q9D0F6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfc5Q9D0F6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfc5Q9D0F6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfc5Q9D0F6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfc5Q9D0F6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfc5Q9D0F6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfc5Q9D0F6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfc5Q9D0F6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfc5Q9D0F6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfc5Q9D0F6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfc5Q9D0F6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfc5Q9D0F6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfc5Q9D0F6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfc5Q9D0F6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfc5Q9D0F6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfc5Q9D0F6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfc5Q9D0F6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfc5Q9D0F6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfc5Q9D0F6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfc5Q9D0F6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfc5Q9D0F6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfc5Q9D0F6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfc5Q9D0F6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rfc5Q9D0F6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rfc5Q9D0F6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfc5Q9D0F6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rfc5Q9D0F6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rfc5Q9D0F6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Rfc5Q9D0F6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rfc5Q9D0F6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfc5Q9D0F6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfc5Q9D0F6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfc5Q9D0F6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfc5Q9D0F6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfc5Q9D0F6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfc5Q9D0F6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfc5Q9D0F6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfc5Q9D0F6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfc5Q9D0F6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rfc5Q9D0F6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfc5Q9D0F6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfc5Q9D0F6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfc5Q9D0F6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rfc5Q9D0F6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rfc5Q9D0F6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms