Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZP0

Ufsp1, Ufm1-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp1Q9CZP0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ufsp1Q9CZP0 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ufsp1Q9CZP0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ufsp1Q9CZP0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms