Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH3

3300002I08Rik, RIKEN cDNA 3300002I08, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3300002I08RikQ9CXH3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
3300002I08RikQ9CXH3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
3300002I08RikQ9CXH3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
3300002I08RikQ9CXH3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
3300002I08RikQ9CXH3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
3300002I08RikQ9CXH3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
3300002I08RikQ9CXH3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
3300002I08RikQ9CXH3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
3300002I08RikQ9CXH3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
3300002I08RikQ9CXH3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
3300002I08RikQ9CXH3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
3300002I08RikQ9CXH3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
3300002I08RikQ9CXH3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
3300002I08RikQ9CXH3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
3300002I08RikQ9CXH3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
3300002I08RikQ9CXH3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
3300002I08RikQ9CXH3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
3300002I08RikQ9CXH3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
3300002I08RikQ9CXH3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
3300002I08RikQ9CXH3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
3300002I08RikQ9CXH3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
3300002I08RikQ9CXH3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
3300002I08RikQ9CXH3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms