Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX92

Gje1, Gap junction epsilon-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gje1Q9CX92 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gje1Q9CX92 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gje1Q9CX92 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gje1Q9CX92 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gje1Q9CX92 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gje1Q9CX92 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gje1Q9CX92 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gje1Q9CX92 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gje1Q9CX92 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gje1Q9CX92 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gje1Q9CX92 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gje1Q9CX92 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gje1Q9CX92 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gje1Q9CX92 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gje1Q9CX92 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gje1Q9CX92 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gje1Q9CX92 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gje1Q9CX92 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gje1Q9CX92 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gje1Q9CX92 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gje1Q9CX92 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gje1Q9CX92 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gje1Q9CX92 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gje1Q9CX92 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gje1Q9CX92 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gje1Q9CX92 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gje1Q9CX92 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gje1Q9CX92 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gje1Q9CX92 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gje1Q9CX92 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gje1Q9CX92 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gje1Q9CX92 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gje1Q9CX92 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gje1Q9CX92 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gje1Q9CX92 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gje1Q9CX92 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gje1Q9CX92 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gje1Q9CX92 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gje1Q9CX92 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gje1Q9CX92 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gje1Q9CX92 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gje1Q9CX92 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gje1Q9CX92 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gje1Q9CX92 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gje1Q9CX92 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gje1Q9CX92 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gje1Q9CX92 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gje1Q9CX92 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gje1Q9CX92 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gje1Q9CX92 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gje1Q9CX92 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gje1Q9CX92 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gje1Q9CX92 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gje1Q9CX92 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gje1Q9CX92 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gje1Q9CX92 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gje1Q9CX92 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gje1Q9CX92 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gje1Q9CX92 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gje1Q9CX92 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gje1Q9CX92 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gje1Q9CX92 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gje1Q9CX92 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gje1Q9CX92 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gje1Q9CX92 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gje1Q9CX92 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 226 ms