Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpusd4Q9CWX4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpusd4Q9CWX4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpusd4Q9CWX4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms