Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Malsu1Q9CWV0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Malsu1Q9CWV0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms