Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NubplQ9CWD8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NubplQ9CWD8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NubplQ9CWD8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NubplQ9CWD8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NubplQ9CWD8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NubplQ9CWD8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NubplQ9CWD8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NubplQ9CWD8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NubplQ9CWD8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NubplQ9CWD8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NubplQ9CWD8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NubplQ9CWD8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NubplQ9CWD8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NubplQ9CWD8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NubplQ9CWD8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NubplQ9CWD8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NubplQ9CWD8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NubplQ9CWD8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NubplQ9CWD8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NubplQ9CWD8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NubplQ9CWD8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NubplQ9CWD8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NubplQ9CWD8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NubplQ9CWD8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NubplQ9CWD8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NubplQ9CWD8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NubplQ9CWD8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NubplQ9CWD8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NubplQ9CWD8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NubplQ9CWD8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NubplQ9CWD8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NubplQ9CWD8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NubplQ9CWD8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NubplQ9CWD8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NubplQ9CWD8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NubplQ9CWD8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NubplQ9CWD8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NubplQ9CWD8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NubplQ9CWD8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms