Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR42

Ankrd1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd1Q9CR42 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ankrd1Q9CR42 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ankrd1Q9CR42 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ankrd1Q9CR42 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ankrd1Q9CR42 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ankrd1Q9CR42 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ankrd1Q9CR42 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ankrd1Q9CR42 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ankrd1Q9CR42 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ankrd1Q9CR42 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ankrd1Q9CR42 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ankrd1Q9CR42 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ankrd1Q9CR42 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ankrd1Q9CR42 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ankrd1Q9CR42 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ankrd1Q9CR42 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ankrd1Q9CR42 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ankrd1Q9CR42 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ankrd1Q9CR42 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ankrd1Q9CR42 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ankrd1Q9CR42 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ankrd1Q9CR42 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ankrd1Q9CR42 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ankrd1Q9CR42 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ankrd1Q9CR42 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ankrd1Q9CR42 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ankrd1Q9CR42 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ankrd1Q9CR42 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ankrd1Q9CR42 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ankrd1Q9CR42 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ankrd1Q9CR42 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ankrd1Q9CR42 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ankrd1Q9CR42 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ankrd1Q9CR42 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ankrd1Q9CR42 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ankrd1Q9CR42 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ankrd1Q9CR42 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ankrd1Q9CR42 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ankrd1Q9CR42 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ankrd1Q9CR42 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ankrd1Q9CR42 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ankrd1Q9CR42 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ankrd1Q9CR42 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ankrd1Q9CR42 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ankrd1Q9CR42 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ankrd1Q9CR42 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ankrd1Q9CR42 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ankrd1Q9CR42 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ankrd1Q9CR42 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ankrd1Q9CR42 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ankrd1Q9CR42 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ankrd1Q9CR42 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ankrd1Q9CR42 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ankrd1Q9CR42 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ankrd1Q9CR42 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ankrd1Q9CR42 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ankrd1Q9CR42 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ankrd1Q9CR42 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ankrd1Q9CR42 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ankrd1Q9CR42 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ankrd1Q9CR42 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ankrd1Q9CR42 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ankrd1Q9CR42 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ankrd1Q9CR42 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ankrd1Q9CR42 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms