Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PompQ9CQT5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PompQ9CQT5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PompQ9CQT5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PompQ9CQT5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PompQ9CQT5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PompQ9CQT5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PompQ9CQT5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PompQ9CQT5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PompQ9CQT5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PompQ9CQT5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PompQ9CQT5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PompQ9CQT5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PompQ9CQT5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PompQ9CQT5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PompQ9CQT5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PompQ9CQT5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PompQ9CQT5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PompQ9CQT5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PompQ9CQT5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PompQ9CQT5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PompQ9CQT5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PompQ9CQT5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PompQ9CQT5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PompQ9CQT5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PompQ9CQT5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PompQ9CQT5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PompQ9CQT5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PompQ9CQT5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PompQ9CQT5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PompQ9CQT5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PompQ9CQT5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PompQ9CQT5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PompQ9CQT5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PompQ9CQT5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PompQ9CQT5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PompQ9CQT5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PompQ9CQT5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PompQ9CQT5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PompQ9CQT5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PompQ9CQT5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PompQ9CQT5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PompQ9CQT5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PompQ9CQT5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PompQ9CQT5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PompQ9CQT5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PompQ9CQT5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PompQ9CQT5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PompQ9CQT5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PompQ9CQT5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PompQ9CQT5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PompQ9CQT5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PompQ9CQT5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PompQ9CQT5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PompQ9CQT5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PompQ9CQT5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PompQ9CQT5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PompQ9CQT5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PompQ9CQT5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PompQ9CQT5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PompQ9CQT5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PompQ9CQT5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PompQ9CQT5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PompQ9CQT5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PompQ9CQT5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PompQ9CQT5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PompQ9CQT5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PompQ9CQT5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PompQ9CQT5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PompQ9CQT5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PompQ9CQT5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PompQ9CQT5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PompQ9CQT5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PompQ9CQT5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PompQ9CQT5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PompQ9CQT5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PompQ9CQT5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PompQ9CQT5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PompQ9CQT5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PompQ9CQT5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PompQ9CQT5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PompQ9CQT5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PompQ9CQT5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PompQ9CQT5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PompQ9CQT5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PompQ9CQT5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PompQ9CQT5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PompQ9CQT5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PompQ9CQT5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PompQ9CQT5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PompQ9CQT5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PompQ9CQT5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PompQ9CQT5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PompQ9CQT5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PompQ9CQT5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PompQ9CQT5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PompQ9CQT5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PompQ9CQT5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PompQ9CQT5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms