Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chchd5Q9CQP3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Chchd5Q9CQP3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Chchd5Q9CQP3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chchd5Q9CQP3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Chchd5Q9CQP3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chchd5Q9CQP3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chchd5Q9CQP3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chchd5Q9CQP3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chchd5Q9CQP3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Chchd5Q9CQP3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chchd5Q9CQP3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chchd5Q9CQP3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Chchd5Q9CQP3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Chchd5Q9CQP3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chchd5Q9CQP3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chchd5Q9CQP3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chchd5Q9CQP3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chchd5Q9CQP3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chchd5Q9CQP3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chchd5Q9CQP3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chchd5Q9CQP3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Chchd5Q9CQP3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chchd5Q9CQP3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chchd5Q9CQP3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chchd5Q9CQP3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chchd5Q9CQP3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chchd5Q9CQP3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chchd5Q9CQP3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chchd5Q9CQP3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chchd5Q9CQP3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Chchd5Q9CQP3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chchd5Q9CQP3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chchd5Q9CQP3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chchd5Q9CQP3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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