Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mrpl11Q9CQF0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mrpl11Q9CQF0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mrpl11Q9CQF0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mrpl11Q9CQF0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mrpl11Q9CQF0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mrpl11Q9CQF0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mrpl11Q9CQF0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mrpl11Q9CQF0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mrpl11Q9CQF0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mrpl11Q9CQF0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Mrpl11Q9CQF0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mrpl11Q9CQF0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mrpl11Q9CQF0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mrpl11Q9CQF0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mrpl11Q9CQF0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mrpl11Q9CQF0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mrpl11Q9CQF0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mrpl11Q9CQF0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mrpl11Q9CQF0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mrpl11Q9CQF0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mrpl11Q9CQF0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mrpl11Q9CQF0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mrpl11Q9CQF0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mrpl11Q9CQF0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mrpl11Q9CQF0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mrpl11Q9CQF0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mrpl11Q9CQF0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mrpl11Q9CQF0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mrpl11Q9CQF0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mrpl11Q9CQF0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mrpl11Q9CQF0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mrpl11Q9CQF0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mrpl11Q9CQF0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mrpl11Q9CQF0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mrpl11Q9CQF0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mrpl11Q9CQF0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mrpl11Q9CQF0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mrpl11Q9CQF0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mrpl11Q9CQF0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms