Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sar1bQ9CQC9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sar1bQ9CQC9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sar1bQ9CQC9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sar1bQ9CQC9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sar1bQ9CQC9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sar1bQ9CQC9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sar1bQ9CQC9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sar1bQ9CQC9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sar1bQ9CQC9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sar1bQ9CQC9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sar1bQ9CQC9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sar1bQ9CQC9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sar1bQ9CQC9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sar1bQ9CQC9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sar1bQ9CQC9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sar1bQ9CQC9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sar1bQ9CQC9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sar1bQ9CQC9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sar1bQ9CQC9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sar1bQ9CQC9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sar1bQ9CQC9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sar1bQ9CQC9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sar1bQ9CQC9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sar1bQ9CQC9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sar1bQ9CQC9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sar1bQ9CQC9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sar1bQ9CQC9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sar1bQ9CQC9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sar1bQ9CQC9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sar1bQ9CQC9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sar1bQ9CQC9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sar1bQ9CQC9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sar1bQ9CQC9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sar1bQ9CQC9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sar1bQ9CQC9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sar1bQ9CQC9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sar1bQ9CQC9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sar1bQ9CQC9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sar1bQ9CQC9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sar1bQ9CQC9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sar1bQ9CQC9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sar1bQ9CQC9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sar1bQ9CQC9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sar1bQ9CQC9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sar1bQ9CQC9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sar1bQ9CQC9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sar1bQ9CQC9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sar1bQ9CQC9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sar1bQ9CQC9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sar1bQ9CQC9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sar1bQ9CQC9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms