Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
1700129C05RikQ9CQ77 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
1700129C05RikQ9CQ77 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700129C05RikQ9CQ77 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700129C05RikQ9CQ77 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
1700129C05RikQ9CQ77 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700129C05RikQ9CQ77 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700129C05RikQ9CQ77 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700129C05RikQ9CQ77 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700129C05RikQ9CQ77 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1700129C05RikQ9CQ77 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
1700129C05RikQ9CQ77 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700129C05RikQ9CQ77 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1700129C05RikQ9CQ77 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700129C05RikQ9CQ77 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700129C05RikQ9CQ77 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
1700129C05RikQ9CQ77 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1700129C05RikQ9CQ77 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700129C05RikQ9CQ77 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700129C05RikQ9CQ77 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
1700129C05RikQ9CQ77 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
1700129C05RikQ9CQ77 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
1700129C05RikQ9CQ77 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
1700129C05RikQ9CQ77 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
1700129C05RikQ9CQ77 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
1700129C05RikQ9CQ77 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700129C05RikQ9CQ77 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
1700129C05RikQ9CQ77 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700129C05RikQ9CQ77 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700129C05RikQ9CQ77 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700129C05RikQ9CQ77 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700129C05RikQ9CQ77 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700129C05RikQ9CQ77 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.3 ms