Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc198Q9CPZ1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc198Q9CPZ1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc198Q9CPZ1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc198Q9CPZ1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc198Q9CPZ1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc198Q9CPZ1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc198Q9CPZ1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms