Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU7

Bap1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap1Q99PU7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Bap1Q99PU7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Bap1Q99PU7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Bap1Q99PU7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bap1Q99PU7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bap1Q99PU7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bap1Q99PU7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bap1Q99PU7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bap1Q99PU7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bap1Q99PU7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Bap1Q99PU7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Bap1Q99PU7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Bap1Q99PU7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Bap1Q99PU7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Bap1Q99PU7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Bap1Q99PU7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Bap1Q99PU7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Bap1Q99PU7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bap1Q99PU7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Bap1Q99PU7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Bap1Q99PU7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Bap1Q99PU7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Bap1Q99PU7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Bap1Q99PU7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Bap1Q99PU7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Bap1Q99PU7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Bap1Q99PU7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Bap1Q99PU7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Bap1Q99PU7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Bap1Q99PU7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Bap1Q99PU7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Bap1Q99PU7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Bap1Q99PU7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Bap1Q99PU7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Bap1Q99PU7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Bap1Q99PU7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Bap1Q99PU7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Bap1Q99PU7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Bap1Q99PU7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Bap1Q99PU7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Bap1Q99PU7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Bap1Q99PU7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Bap1Q99PU7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Bap1Q99PU7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Bap1Q99PU7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Bap1Q99PU7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Bap1Q99PU7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Bap1Q99PU7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Bap1Q99PU7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Bap1Q99PU7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Bap1Q99PU7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Bap1Q99PU7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Bap1Q99PU7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Bap1Q99PU7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Bap1Q99PU7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Bap1Q99PU7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Bap1Q99PU7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Bap1Q99PU7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Bap1Q99PU7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Bap1Q99PU7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Bap1Q99PU7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Bap1Q99PU7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Bap1Q99PU7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Bap1Q99PU7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Bap1Q99PU7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Bap1Q99PU7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Bap1Q99PU7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Bap1Q99PU7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Bap1Q99PU7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Bap1Q99PU7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Bap1Q99PU7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Bap1Q99PU7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Bap1Q99PU7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Bap1Q99PU7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Bap1Q99PU7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Bap1Q99PU7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Bap1Q99PU7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Bap1Q99PU7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Bap1Q99PU7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Bap1Q99PU7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Bap1Q99PU7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Bap1Q99PU7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Bap1Q99PU7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Bap1Q99PU7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Bap1Q99PU7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Bap1Q99PU7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Bap1Q99PU7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Bap1Q99PU7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Bap1Q99PU7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Bap1Q99PU7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Bap1Q99PU7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Bap1Q99PU7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Bap1Q99PU7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Bap1Q99PU7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Bap1Q99PU7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Bap1Q99PU7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Bap1Q99PU7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Bap1Q99PU7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Bap1Q99PU7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Bap1Q99PU7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms