Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930550L24RikQ99PA7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
4930550L24RikQ99PA7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930550L24RikQ99PA7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930550L24RikQ99PA7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
4930550L24RikQ99PA7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930550L24RikQ99PA7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930550L24RikQ99PA7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930550L24RikQ99PA7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930550L24RikQ99PA7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930550L24RikQ99PA7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930550L24RikQ99PA7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930550L24RikQ99PA7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930550L24RikQ99PA7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930550L24RikQ99PA7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930550L24RikQ99PA7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930550L24RikQ99PA7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930550L24RikQ99PA7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930550L24RikQ99PA7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930550L24RikQ99PA7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930550L24RikQ99PA7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930550L24RikQ99PA7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930550L24RikQ99PA7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930550L24RikQ99PA7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930550L24RikQ99PA7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930550L24RikQ99PA7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930550L24RikQ99PA7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930550L24RikQ99PA7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
4930550L24RikQ99PA7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930550L24RikQ99PA7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930550L24RikQ99PA7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930550L24RikQ99PA7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930550L24RikQ99PA7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930550L24RikQ99PA7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930550L24RikQ99PA7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930550L24RikQ99PA7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
4930550L24RikQ99PA7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930550L24RikQ99PA7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930550L24RikQ99PA7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930550L24RikQ99PA7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
4930550L24RikQ99PA7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930550L24RikQ99PA7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930550L24RikQ99PA7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 268.3 ms