Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sf3b1Q99NB9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sf3b1Q99NB9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sf3b1Q99NB9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sf3b1Q99NB9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sf3b1Q99NB9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sf3b1Q99NB9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sf3b1Q99NB9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sf3b1Q99NB9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sf3b1Q99NB9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sf3b1Q99NB9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sf3b1Q99NB9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sf3b1Q99NB9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sf3b1Q99NB9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sf3b1Q99NB9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sf3b1Q99NB9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sf3b1Q99NB9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sf3b1Q99NB9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sf3b1Q99NB9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sf3b1Q99NB9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sf3b1Q99NB9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sf3b1Q99NB9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sf3b1Q99NB9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sf3b1Q99NB9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sf3b1Q99NB9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sf3b1Q99NB9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sf3b1Q99NB9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sf3b1Q99NB9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sf3b1Q99NB9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sf3b1Q99NB9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sf3b1Q99NB9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sf3b1Q99NB9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sf3b1Q99NB9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sf3b1Q99NB9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sf3b1Q99NB9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sf3b1Q99NB9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sf3b1Q99NB9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sf3b1Q99NB9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sf3b1Q99NB9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sf3b1Q99NB9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sf3b1Q99NB9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sf3b1Q99NB9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sf3b1Q99NB9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b1Q99NB9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b1Q99NB9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b1Q99NB9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b1Q99NB9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b1Q99NB9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b1Q99NB9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b1Q99NB9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sf3b1Q99NB9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sf3b1Q99NB9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sf3b1Q99NB9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3b1Q99NB9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3b1Q99NB9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3b1Q99NB9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3b1Q99NB9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sf3b1Q99NB9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sf3b1Q99NB9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sf3b1Q99NB9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sf3b1Q99NB9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Sf3b1Q99NB9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sf3b1Q99NB9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3b1Q99NB9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3b1Q99NB9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3b1Q99NB9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3b1Q99NB9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3b1Q99NB9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms