Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU8

Uncharacterized protein C6orf62 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99LU8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q99LU8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q99LU8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q99LU8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q99LU8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q99LU8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q99LU8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q99LU8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q99LU8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q99LU8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q99LU8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q99LU8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q99LU8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q99LU8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q99LU8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q99LU8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q99LU8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q99LU8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q99LU8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q99LU8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q99LU8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q99LU8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q99LU8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q99LU8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q99LU8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q99LU8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q99LU8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q99LU8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q99LU8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q99LU8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q99LU8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q99LU8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q99LU8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q99LU8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q99LU8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q99LU8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q99LU8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q99LU8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q99LU8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q99LU8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q99LU8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q99LU8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q99LU8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q99LU8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q99LU8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q99LU8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q99LU8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q99LU8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q99LU8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q99LU8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q99LU8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q99LU8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q99LU8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q99LU8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q99LU8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q99LU8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q99LU8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q99LU8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q99LU8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q99LU8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q99LU8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q99LU8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q99LU8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q99LU8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q99LU8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q99LU8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q99LU8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q99LU8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q99LU8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q99LU8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q99LU8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q99LU8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q99LU8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q99LU8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q99LU8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q99LU8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q99LU8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q99LU8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q99LU8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q99LU8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q99LU8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Q99LU8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q99LU8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q99LU8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q99LU8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q99LU8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q99LU8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q99LU8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q99LU8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q99LU8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Q99LU8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q99LU8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q99LU8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q99LU8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q99LU8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q99LU8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q99LU8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q99LU8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Q99LU8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Q99LU8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms