Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Apobec3Q99J72 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apobec3Q99J72 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apobec3Q99J72 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apobec3Q99J72 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apobec3Q99J72 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Apobec3Q99J72 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Apobec3Q99J72 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Apobec3Q99J72 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apobec3Q99J72 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apobec3Q99J72 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apobec3Q99J72 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apobec3Q99J72 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apobec3Q99J72 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apobec3Q99J72 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apobec3Q99J72 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apobec3Q99J72 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apobec3Q99J72 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apobec3Q99J72 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apobec3Q99J72 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apobec3Q99J72 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apobec3Q99J72 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apobec3Q99J72 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apobec3Q99J72 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apobec3Q99J72 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apobec3Q99J72 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apobec3Q99J72 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Apobec3Q99J72 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Apobec3Q99J72 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Apobec3Q99J72 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Apobec3Q99J72 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Apobec3Q99J72 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apobec3Q99J72 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apobec3Q99J72 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apobec3Q99J72 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apobec3Q99J72 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apobec3Q99J72 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Apobec3Q99J72 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Apobec3Q99J72 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Apobec3Q99J72 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Apobec3Q99J72 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apobec3Q99J72 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.8 ms