Protein–RNA interactions for Protein: Q922Q2

Riok1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok1Q922Q2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Riok1Q922Q2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Riok1Q922Q2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Riok1Q922Q2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Riok1Q922Q2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Riok1Q922Q2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Riok1Q922Q2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Riok1Q922Q2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Riok1Q922Q2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Riok1Q922Q2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Riok1Q922Q2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Riok1Q922Q2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Riok1Q922Q2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Riok1Q922Q2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Riok1Q922Q2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Riok1Q922Q2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Riok1Q922Q2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Riok1Q922Q2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Riok1Q922Q2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Riok1Q922Q2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Riok1Q922Q2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Riok1Q922Q2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Riok1Q922Q2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Riok1Q922Q2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Riok1Q922Q2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Riok1Q922Q2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Riok1Q922Q2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Riok1Q922Q2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Riok1Q922Q2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Riok1Q922Q2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Riok1Q922Q2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Riok1Q922Q2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Riok1Q922Q2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Riok1Q922Q2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Riok1Q922Q2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Riok1Q922Q2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Riok1Q922Q2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Riok1Q922Q2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Riok1Q922Q2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Riok1Q922Q2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Riok1Q922Q2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Riok1Q922Q2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Riok1Q922Q2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Riok1Q922Q2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Riok1Q922Q2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Riok1Q922Q2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Riok1Q922Q2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Riok1Q922Q2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Riok1Q922Q2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Riok1Q922Q2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Riok1Q922Q2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Riok1Q922Q2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Riok1Q922Q2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Riok1Q922Q2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Riok1Q922Q2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Riok1Q922Q2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Riok1Q922Q2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Riok1Q922Q2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Riok1Q922Q2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Riok1Q922Q2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Riok1Q922Q2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Riok1Q922Q2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Riok1Q922Q2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Riok1Q922Q2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Riok1Q922Q2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Riok1Q922Q2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Riok1Q922Q2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Riok1Q922Q2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Riok1Q922Q2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Riok1Q922Q2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Riok1Q922Q2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Riok1Q922Q2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Riok1Q922Q2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Riok1Q922Q2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Riok1Q922Q2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Riok1Q922Q2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Riok1Q922Q2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Riok1Q922Q2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Riok1Q922Q2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Riok1Q922Q2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Riok1Q922Q2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Riok1Q922Q2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Riok1Q922Q2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Riok1Q922Q2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Riok1Q922Q2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Riok1Q922Q2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Riok1Q922Q2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Riok1Q922Q2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Riok1Q922Q2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Riok1Q922Q2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Riok1Q922Q2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Riok1Q922Q2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Riok1Q922Q2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Riok1Q922Q2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Riok1Q922Q2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Riok1Q922Q2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Riok1Q922Q2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Riok1Q922Q2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Riok1Q922Q2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Riok1Q922Q2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms