Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Synpo2Q91YE8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Synpo2Q91YE8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Synpo2Q91YE8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Synpo2Q91YE8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Synpo2Q91YE8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Synpo2Q91YE8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Synpo2Q91YE8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Synpo2Q91YE8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Synpo2Q91YE8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Synpo2Q91YE8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Synpo2Q91YE8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Synpo2Q91YE8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Synpo2Q91YE8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Synpo2Q91YE8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms