Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Creb3l3Q91XE9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Creb3l3Q91XE9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Creb3l3Q91XE9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Creb3l3Q91XE9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Creb3l3Q91XE9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Creb3l3Q91XE9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Creb3l3Q91XE9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Creb3l3Q91XE9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Creb3l3Q91XE9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Creb3l3Q91XE9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Creb3l3Q91XE9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Creb3l3Q91XE9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Creb3l3Q91XE9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Creb3l3Q91XE9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Creb3l3Q91XE9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Creb3l3Q91XE9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Creb3l3Q91XE9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Creb3l3Q91XE9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Creb3l3Q91XE9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Creb3l3Q91XE9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms