Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx15Q91WE1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx15Q91WE1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx15Q91WE1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx15Q91WE1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx15Q91WE1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx15Q91WE1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx15Q91WE1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx15Q91WE1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx15Q91WE1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx15Q91WE1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx15Q91WE1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx15Q91WE1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx15Q91WE1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx15Q91WE1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx15Q91WE1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx15Q91WE1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx15Q91WE1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx15Q91WE1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx15Q91WE1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx15Q91WE1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snx15Q91WE1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Snx15Q91WE1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Snx15Q91WE1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx15Q91WE1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx15Q91WE1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx15Q91WE1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms