Protein–RNA interactions for Protein: Q91W27

Pth2, Tuberoinfundibular peptide of 39 residues, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pth2Q91W27 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pth2Q91W27 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pth2Q91W27 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pth2Q91W27 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pth2Q91W27 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pth2Q91W27 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pth2Q91W27 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pth2Q91W27 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pth2Q91W27 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pth2Q91W27 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pth2Q91W27 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pth2Q91W27 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pth2Q91W27 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pth2Q91W27 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pth2Q91W27 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pth2Q91W27 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pth2Q91W27 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pth2Q91W27 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pth2Q91W27 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pth2Q91W27 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pth2Q91W27 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pth2Q91W27 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pth2Q91W27 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pth2Q91W27 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pth2Q91W27 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pth2Q91W27 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pth2Q91W27 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pth2Q91W27 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pth2Q91W27 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pth2Q91W27 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pth2Q91W27 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pth2Q91W27 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pth2Q91W27 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pth2Q91W27 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pth2Q91W27 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pth2Q91W27 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pth2Q91W27 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms