Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tdrd3Q91W18 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tdrd3Q91W18 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tdrd3Q91W18 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tdrd3Q91W18 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tdrd3Q91W18 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tdrd3Q91W18 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tdrd3Q91W18 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tdrd3Q91W18 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tdrd3Q91W18 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tdrd3Q91W18 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tdrd3Q91W18 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tdrd3Q91W18 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tdrd3Q91W18 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Tdrd3Q91W18 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tdrd3Q91W18 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tdrd3Q91W18 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tdrd3Q91W18 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tdrd3Q91W18 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tdrd3Q91W18 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tdrd3Q91W18 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tdrd3Q91W18 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tdrd3Q91W18 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tdrd3Q91W18 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tdrd3Q91W18 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tdrd3Q91W18 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tdrd3Q91W18 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tdrd3Q91W18 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tdrd3Q91W18 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tdrd3Q91W18 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tdrd3Q91W18 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Tdrd3Q91W18 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tdrd3Q91W18 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tdrd3Q91W18 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tdrd3Q91W18 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tdrd3Q91W18 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tdrd3Q91W18 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tdrd3Q91W18 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tdrd3Q91W18 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tdrd3Q91W18 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tdrd3Q91W18 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tdrd3Q91W18 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tdrd3Q91W18 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tdrd3Q91W18 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tdrd3Q91W18 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tdrd3Q91W18 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tdrd3Q91W18 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tdrd3Q91W18 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tdrd3Q91W18 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tdrd3Q91W18 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tdrd3Q91W18 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tdrd3Q91W18 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tdrd3Q91W18 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tdrd3Q91W18 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tdrd3Q91W18 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tdrd3Q91W18 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Tdrd3Q91W18 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tdrd3Q91W18 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tdrd3Q91W18 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tdrd3Q91W18 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tdrd3Q91W18 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tdrd3Q91W18 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tdrd3Q91W18 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tdrd3Q91W18 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tdrd3Q91W18 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms