Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn8Q91VA3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn8Q91VA3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capn8Q91VA3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn8Q91VA3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn8Q91VA3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn8Q91VA3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn8Q91VA3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capn8Q91VA3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn8Q91VA3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn8Q91VA3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn8Q91VA3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn8Q91VA3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn8Q91VA3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capn8Q91VA3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn8Q91VA3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capn8Q91VA3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn8Q91VA3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn8Q91VA3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn8Q91VA3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn8Q91VA3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn8Q91VA3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capn8Q91VA3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn8Q91VA3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn8Q91VA3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn8Q91VA3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn8Q91VA3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Capn8Q91VA3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn8Q91VA3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn8Q91VA3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn8Q91VA3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn8Q91VA3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn8Q91VA3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn8Q91VA3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capn8Q91VA3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn8Q91VA3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn8Q91VA3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capn8Q91VA3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Capn8Q91VA3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms