Protein–RNA interactions for Protein: Q91V10

Vsx1, Visual system homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx1Q91V10 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vsx1Q91V10 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vsx1Q91V10 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vsx1Q91V10 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vsx1Q91V10 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vsx1Q91V10 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vsx1Q91V10 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vsx1Q91V10 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vsx1Q91V10 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vsx1Q91V10 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vsx1Q91V10 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vsx1Q91V10 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vsx1Q91V10 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vsx1Q91V10 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vsx1Q91V10 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vsx1Q91V10 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vsx1Q91V10 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vsx1Q91V10 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vsx1Q91V10 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vsx1Q91V10 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vsx1Q91V10 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vsx1Q91V10 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vsx1Q91V10 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vsx1Q91V10 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vsx1Q91V10 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vsx1Q91V10 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vsx1Q91V10 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vsx1Q91V10 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vsx1Q91V10 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vsx1Q91V10 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vsx1Q91V10 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vsx1Q91V10 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vsx1Q91V10 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vsx1Q91V10 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vsx1Q91V10 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vsx1Q91V10 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vsx1Q91V10 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vsx1Q91V10 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vsx1Q91V10 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vsx1Q91V10 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vsx1Q91V10 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vsx1Q91V10 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vsx1Q91V10 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vsx1Q91V10 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vsx1Q91V10 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vsx1Q91V10 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vsx1Q91V10 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vsx1Q91V10 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vsx1Q91V10 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vsx1Q91V10 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vsx1Q91V10 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vsx1Q91V10 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vsx1Q91V10 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vsx1Q91V10 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vsx1Q91V10 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vsx1Q91V10 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vsx1Q91V10 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vsx1Q91V10 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vsx1Q91V10 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vsx1Q91V10 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vsx1Q91V10 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vsx1Q91V10 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vsx1Q91V10 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vsx1Q91V10 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms